Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms