Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBSQ01459 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms