Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1AP62820 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1AP62820 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms