Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms