Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA1P59665 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA1P59665 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms