Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA9P57773 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms