Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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