Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCT3P49368 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms