Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms