Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX1P48742 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX1P48742 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX1P48742 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX1P48742 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX1P48742 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX1P48742 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms