Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP5P45974 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP5P45974 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP5P45974 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP5P45974 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms