Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBX2P40425 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms