Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THBS4P35443 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THBS4P35443 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms