Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms