Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms