Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms