Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms