Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms