Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms