Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms