Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPGDP15428 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPGDP15428 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPGDP15428 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPGDP15428 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPGDP15428 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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