Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms