Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms