Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM10L2BP0DMW5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms