Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF888P0CJ79 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF888P0CJ79 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms