Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPBP07988 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPBP07988 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPBP07988 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SFTPBP07988 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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