Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms