Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX4O95219 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms