Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSVO60911 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSVO60911 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSVO60911 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSVO60911 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSVO60911 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSVO60911 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms