Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCO2O43819 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCO2O43819 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms