Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCAO15360 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FANCAO15360 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FANCAO15360 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FANCAO15360 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCAO15360 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCAO15360 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms