Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms