Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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USP17L12C9JPN9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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USP17L12C9JPN9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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USP17L12C9JPN9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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