Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms