Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BRPF3Q9ULD4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms