Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH7Q9ULB5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms