Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms