Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms