Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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