Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNPLA3Q9NST1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms