Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms