Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SEBOXQ9HB31 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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