Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms