Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL15Q96M94 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms