Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms