Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms