Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms