Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms