Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms