Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM54Q969K7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms